אוטונומיה במהלך הנקה מתייחסת ליכולת של האם לבחור כיצד, מתי ואיפה להניק את הילד שלה. זהו תהליך חשוב שאינו רק פיזי, אלא גם נפשי, המאפשר לאם לחוות את ההנקה בצורה חופשית ונוחה. ההנקה היא לא רק פעולה ביולוגית, אלא גם חוויה רגשית שמחברת בין האם לתינוק. כאשר האם חשה כי יש לה שליטה על התהליך, זה תורם להרגשה טובה יותר ולהגברת הביטחון העצמי שלה.